工程预算增加工程是“猫腻”较多的地方，究其原因，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。有些承包商在“低价中标法”中不计成本得到工程后，为了弥补损失，千方百计增加工程签证，在利益诱惑下，某些项目管理者乱签证、补签证现象严重 ，审计人员一旦认真复核，通常会发现签证工程量与实际出入较大。安装、装饰及园林工程结算取定的材料单价和市场行情出入很大，有的甚至“偷梁换柱”。例如某国产灯具安装材料套用进口材料价格，工地现场的名贵树种规格和结算书的规格大相径庭，通过现场勘查取证 ，工程预算水分被大大挤压出来。
工程预算的审核依据主要包括：
1、 有关工程建设和造价管理的法律、法规和方针政策。
2、施工图设计项目一览表、各专业施工图设计图纸和文字说明、工程地质勘察资料。
3、主管部门颁布的现行预算定额以及工程量清单计价规范。
4、施工组织设计或施工方案。
5、费用计算规则及取费标准。
6、预算工作手册或建材五金手册。
7、地区人工工资、材料及机械台班预算价格若有两次以上结算或签订两份以上合同产生两份以上结算时，在分次结算中要注意之前结算与之后结算的工程量衔接，之前结算一定要用文字或图示标（说）明已结范围和位置，之后结算要在结算前先核对之前各结算书已结时间段、位置和范围，避免重复。要求现场工程师在向成本控制中心报送资料中定要注明每次结算的实际施工位置或距离。
对分包工程合同履行过程的事中审计监督是分包工程全过程跟踪审计的第二步。审计的重点是分包工程量计量、施工现场变更、材料使用等审计要素工程量计量的准确性，现场签证的真实性。工程量的大小决定着分包工程的终造价，是确定分包工程预算的根本。工程量的准确性，将直接决定着分包工程的审计质量。事中审计监督就是要突出对分包工程实施过程的审计，强调变更签证工作量的现场审计。内审人员要按施工阶段定期或不定期地深入施工现场，对实际发生的工程量，进行现场丈量和取证核实，落实变更签证确认程序和内容的合理性，是否存在违规签证，虚增工程量，提高分包工程量的真实性和准确性。
云南工程预算控制包括投资决策阶段、设计阶段、建设项目发包阶段和建设实施阶段四个阶段。建设工程项目具有施工周期长、涉及范围广、施工地点不固定、占用资金量大、施工机械设备多等特点。同时，建设工程项目的工程质量、工程进度和云南工程预算之间有着直接的关系，三者既相互统一，又相互制约和矛盾。因此，对于整个建设工程项目来说控制其云南工程预算极其重要。当前我国的建设程度基本上包括四个阶段，各阶段特点具体如下：目前，我国的建设程序基本上是投资决策阶段，工程设计阶段，工程实施阶段，竣工验收阶段。项目的前期阶段即为建设项目施工前各阶段的总称。①投资决策阶段需要编制初步投资估算，做可行性研究报告，由于该阶段是属于投资估算阶段，所以与终项目结算价格会存在较大差别，该阶段造价控制重点是保证投资资源充足。②在设计阶段，在不影响结构合理设计的前提下，设计单位应根据业主建设单位的设计委托书合理控制预算。③在施工工程实施阶段，以合同价为基础，按照承包方实际完成的工程量拨付工程款，同时还应该考虑到由于各种因素可能会引起的工程费用上涨，比如物价上涨等，合理确定结算价。④在竣工验收阶段，将整个工程建设过程中的各项费用进行汇集，编制竣工决算。