工程预算的计算是整个工程项目过程中为复杂的过程，也是非常关键的环节，预算人员一定要严格遵循工程量的计算原则，结合其他工程，统筹兼顾。，计算顺序的合理性。要依照先地下后地上，先内后外。分部工程顺序则要先从混凝土工程中抽取钢筋，再依照砌体、楼地面、屋面、装饰、零星工程的顺序来计算。第二，计算项目确定的合理性。要相对应地把原始数据与相应部位进行标注，要完整且准确地填写名称，对分布在不同部位的相同做法也要分别地进行标注，为后期的核对减少麻烦。准确的套用定额。工程量计算完并核对之后，用所得的分部分项工程量套用的单位估价表的定额基价，相乘、累加，得出来的就是分项工程量的合计。在使用定额之前，首先要地了解总工程、分部工程的情况，掌握编制的使用范围及依据。
工程预算签证是施工合同和施工图中未包括，且预算定额取费也未考虑的，而实际施工中又确实发生费用的内容，需要做现场工程签证。一般由承包商提出，监理工程师或发包商核实签字批准。工程签证产生的原因主要有由于不可预见的因素产生的工程签证。如基础开挖时，发现有软弱下卧层等不良地基，需进行换填，这时需发包商现场管理人员核实后工程签证。一般来说在合同当中会就此做出相应的规定，例如因恶劣天气、一周内累计超过8小时的停水停电等造成的工期工程签证、经济工程签证等。由于发包商原因等非承包商原因，工程中途停建、缓建或未按合同规定的时间和要求提供材料、场地、设备资料等造成承包商的停工、窝工、返工而发生的倒运、人员和机械的调迁、二次搬运等损失。与设备安装工程等其他工程交叉作业产生的工程签证。
如对某单位一土建工程预算项目进行审计，审计人员通过审查发现该项目与以往审计过的某幢建筑物A的设计完全想同，经过测算该项目的经济造价指标和部分材料指标均高出A建设工程，审计人员进一步审计发现该项工程多计钢材16.3t；商品砼多计128.8m3。由于上年价格指数变动不大，且使用的是同一估价本，所以审计人员在审计过程中只考虑价差问题未考虑价格上涨指数，审计人员核减工程造价合计15.78万元。即审计人员在审计过程中由于子目过多，审计过程中可以对工程量、金额数目较大的子目进行筛选核对，确定核实建设项目决算工程量和造价的真实性、合理性的一种审计方法。
例如，在某工程造价进行审计时，发现程项目很多，投资较大 ，如要对每个项目都进行审计，将要耗费大量的时间和精力。针对这一情况 ，审计人员在制定审计实施方案时 ，决定采用重点抽查法进行本次工程预算。经排查 ，发现天花进口矿棉板报价80 元/ m2，这个价格比市场上同类产品高出许多，为了保证审计质量，降低审计风险，审计人员一方面要求有关单位提供该进口材料的海关报关单、购销合同和发票 ，另一方面又持单位介绍信到该进口矿棉板代理处直接查询，经过三番两次的调查取证 ，终于在较短的时间内了解到有关该材料的实际价格情况。在确凿证据的面前，有关单位终同意按 56 元/m2进行结算，仅此一项就核减工程造价 1556167.60 元 ，为政府节约了大量的财政资金。又可称为经验法。在工程预算过程中，通常会发现不同的项目中存在相同或类似的问题 ，这些问题工程造价结算的“通病”，通过审计这些典型问题 ，可以达到较好的审计效果。在审计工作中常遇到的典问题的主要特征有以下几种。涂改原始签证资料或虚列工程项目。有关单位工作人员在送审计资料时，私自涂改原始签证资料或虚列工程项目，企图蒙混过关 ，达到个人的。因此 ，审计人员必须仔细对照原始签证资料，认真核实每一份复印文件的真伪。增加工程是“猫腻”较多的地方 ，究其原因 ，主要是设计单位设计深度不够，建设单位责任心不强。