工程结算审核主要对结算书编制合规性审核，并对照设计图纸、工程招标文件、投标文件与工程合同、预算及已批准的设计变更、洽商索赔等进行复核，检查是否有重复报项和甲供材料款少扣、漏扣等现象，确定结算内容的真实性。工程预算为保证工程竣工终通过政府审计，作为全过程造价咨询单位首先要为业主把好结算审核关。根据我公司长期对政府项目的工程审计经验，确定本项目工程竣工结算审核重点如下：审核施工合同中确定的建设标准、建设内容、合同价格是否与投标书承诺内容一致，是否控制在批准的初步设计及概算文件规定范围内。
从工程预算编制方面入手在工程项目成本控制中，工程预算编制方案无疑是重要的因素，它不仅在整个工程建设中起到导航作用，而且是概预算数据计算时的一个根本出发点。方案工程预算编制必须从经济观点出发。另外，工程预算编制方案的内容无疑是概预算进行编制时需要详细掌握的基本内容之一，编制员工要的掌握工程预算编制方案的内容，仔细分析其可行性和科学性。在充分掌握工程预算编制方案后，再进行概预算工作，能够有效地提高工作效率、减少误差、增加数据科学性和合理性。
承包工程合同签定不规范，工程结算计价难以确定。工程预算在审计过程中发现，建设、施工双方承包工程合同签订不规范。在签订合同时不按投标文件的内容逐一填写，尤其是建筑规模和中标价，存在少填或者不填的现象，给工程计价取费留下活口，目的是为了竣工后高报工程结算价格打下伏笔，使得原本十分严肃的合同失去约束作用，建设单位失去了对施工单位工程报价的有效监督，容易造成决算价格偏高。同时，给工程结算造价审核带来难度和风险。
工程预算承包人按专业条款的约定时间，提交当月(或节点)完成形象进度，监理工程师(或甲方代表)在规定的时间内核实已完工程量。对合同范围内的工程量和变更的工程量分别签证认可。（2）承包人根据工程量检验认可的证明，编制当月(节点)的工程量完成统计报表(按合同要求)及月度(节点)工程价款结算书，提供进度款申请并附上与进度款审批有关的支持材料。报基建部门，由委托的造价咨询单位确认。（3）对月度(节点)工程价款结算书进行审核，首先审核签证记录的真实性、合法性，然后核定确认工程量；审核工程所套定额或清单价是否与工程执行定额或清单子目相符，实物工程量与图纸不符、施工情况与施工合同不符、施工用料发生变化